口袋妖怪大师EX通过引入新的游戏模式，事件和同步对来庆祝其三周年，包括所有口袋妖怪二人组中最具标志性的。在口袋妖怪视频游戏中，玩家第一次可以扮演小智凯彻姆本人进行战斗。

小智和皮卡丘可以说是游戏界最知名的二人组之一，这标志着玩家第一次可以扮演他们。此同步对还引入了游戏中的第一个伙伴动作，B Thunderbolt。二人组还拥有电影同步动作 Best Buds 10，000，000 伏特雷电，这是一个充满破坏性的动作。灰大师公平侦察兵可用至 16 月 <> 日，有足够的时间来收集这支标志性的团队。

为了庆祝这个值得注意的时刻，目前正在进行三场特别活动，以二人组为特色。与小智的炽热之战讲述了名义上的角色参加刚刚抵达帕西奥的训练师锦标赛。来自 Ash 的挑战要求玩家与年轻的训练师正面交锋，而经典的霹雳是一场 1 对 1 的战斗，小智和皮卡丘与主角和他们的皮卡丘在一场真正激动人心的比赛中。

除了这个新对之外，还引入了另外三对。Giovanni (Classic) & Persian現在可透過參加特別同步對對活動：Giovanni & Persian來匯取。Sygna Suit Cynthia (Aura) & Lucario将于29月2日至31月2日进行侦察，其中包括新的Buddy Move，B Aura Sphere。最后，Sygna Suit Red(Thunderbolt)和皮卡丘将在<>月<>日至<>月<>日进行侦察，并将拥有Dynamax造成巨大伤害的能力。

还发布了一种新模式，称为教练小屋。这让玩家有机会与Pasio上的许多训练师互动并建立友谊。某些培训师可以被邀请作为嘉宾并讨论各种主题，获得剪贴簿照片和友谊故事，或被送去探险以获得奖励。